immport免疫数据库

immport免疫数据库怎么后续分析

InnateDB:不只是一个先天免疫数据库。先天免疫反应是免疫的关键分支,它不仅提供了抵御病原体的第一道防线,而且还调节和塑造后续的适应性反应。 TCGA数据挖掘终结者:cBioPortal 结果包括 OncoPrint(基因突变图谱)、Cancer Types Summary(泛癌种基因突变汇总)、Plots(分析拷贝数变异与基因突变或者基因表达的相关性)、Mutatio...

immport数据库网址

ImmPort项目是收集、整理、共享免疫学相关研究的资源,由为不同的生命科学研究者社区提供科学数据的归档和交换方面的先进信息技术支持,并作为研究和临床数据的长期、可持续的归档。ImmPort的核心组件是一个广泛的数据仓库,其中包含实验数据和描述研究目的和数据生成方法的元数据。 数据库简介 The Immunology Database and ...

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在一些纯生信分析的文章里,最后往往需要利用Human Protein Atlas(HPA)数据库来对目标基因进行蛋白表达水平的验证。但是,直接从HPA下载的免疫组化图片往往比较单调,缺乏对结果细节的展示,比如这样: 但是高分文献里展示的图片却长这样: 是不是高级了许多,是不是感受到了差距…没关系,今天小编手把手教会你,用PS绘制高级...

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国际免疫遗传学数据库

然后,从ImmPort数据库下载了2498个IRG(免疫基因),从Cistrome数据库下载了318个TF。对PTC样本和正常样本进行差异分析,得到了1648个差异基因,然后从差异基因中筛选出355个差异表达的IRG和43个差异表达的TF(图2a,b)。对差异表达的IRGs和TFs进行了GO和KEGG通路富集生信分析。GO生信分析结果显示IRGs主要富集于细胞趋化,...

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基因与癌症免疫治疗的关联的数据库

白介素同学发现一个好用到爆的免疫组学数据库,分享给大家。 数据库简称10KIP, 全称10,000 Immunomes Project,看起来就很霸气,这个数据库呢其实应该是一个二次数据库,是通过原有数据库进行了数据整理挖掘,标准化建立起来的,它基于的原始数据库是ImmPort数据库。 基本情况 首先看看大概长啥样,数据库界面非常简洁干...

风湿免疫公共数据库

图二LSP项目分布及流行病学数据 美国LSP项目作为开展较早、规模较大的风湿免疫领域以人群为基础的疾病登记专病队列,为今后各国类似队列的建立提供了一定参考意义。随着我国医院信息系统、临床研究电子采集系统、纸质病历电子化在各级医疗机构的普及,以及逐渐...

免疫细胞数据库推荐

中国科学院深圳先进技术研究院医药所癌症免疫研究中心赵佳伟联合哈佛大学医学院附属波士顿儿童医院杰出副教授、麻省理工学院布罗德研究所研究员 Vijay Sankaran 团队在《细胞》发表最新研究。研究团队运用英国生物样本数据库(UK Biobank),对超 46 万个病人样本进行了遗传学...

免疫治疗检测数据库

图1. CGDB数据库:整合自Flatiron临床数据和Foundation Medicine 基因检测数据 图2. FoundationOne Assay检测流程 CGDB队列中入组接受免疫治疗的1310例晚期NSCLC患者的临床数据和NGS检测数据,这些患者接受的免疫治疗药物包括帕博利珠单抗、纳武利尤单抗和Atezolizumab。在CGDB数据库中,根据影像学、病理学和临床证据评估患者的肿...